gio_kiborg Posted February 8, 2011 Posted February 8, 2011 არის ასეთი პროგრამა The Art of Molecular Dynamics Simulation - 2nd edn ჩემდა სამწუხაროდ, არის Unix სისტემებისთვის (კერძოდ, წითელქუდა ლინუქსის მე-9 ვერსიაზეა გატესტილი) თუკი ვინმე იყენებთ ამ ან მის ახლო მონათესავე დისტროს იქნებ გატესტოთ? (თუ დაკომპილირდება და ჩაირთვება ნორმალურად) Download artmdsim2.tar.gz და თუ არის საშუალება მისი კომპილაციისა Windows-ისთვის? თუ არა ალბათ VMWare-ზე მაინც ავამუშავებ...
OverDozeD Posted February 8, 2011 Posted February 8, 2011 წითელქუდას არ ვიყენებ, უბუნტუზე ცდა ღირს? ვცადე უბუნტუზე და sh-თი ვერაფრით გავუშვი.fedora live CD-თ გაუშვი, ეგეც წითელქუდას ჯიშისაა :)
gio_kiborg Posted February 8, 2011 Author Posted February 8, 2011 ჯიგარ OK, ვდი აბა სხვა კომპილატორით არ იმუშავებს ნეტავ?
Classical Posted February 10, 2011 Posted February 10, 2011 http://www.cygwin.com/ მაგრამ მინიმუმ path ები მაინც უნდა შეცვალო სორსში და მერე ააშენო
gio_kiborg Posted February 10, 2011 Author Posted February 10, 2011 http://www.cygwin.com/ მაგრამ მინიმუმ path ები მაინც უნდა შეცვალო სორსში და მერე ააშენო ვა, საინტერესო რარაც ჩანს, ვსინჯავ აბა...
ზუბა Posted February 10, 2011 Posted February 10, 2011 ეს ალბათ GCC-ს იყენებს, თუ კროს პლატფორმულად არის დაწერილი დაკომპილირდება ვინდოზავრზე და თუ მარტო ლინუქსის კოდია შესაბამისად ვერა ;)
gio_kiborg Posted February 11, 2011 Author Posted February 11, 2011 პროგრამირების ენებში ვერ ვერკვევი მაინც და მაინც... თუმცა,ამ პროგის Readme-ში ეწერა რომ გატესტილია RedHatLinux 9-ზე, რომელიც საკმაოდ ძველია, ახლა Red Hat Linux Enterprise-ს უშვებენ როგორც ვნახე, ხოლო Red Hat-ის გამგრძელებელი Fedora არის ხომ? ვიწერ მე-9 წითელქუდასაც,(3CD არის სულ) რესურსები საკმაოდ მცირე სჭირდება და ვირტუალურზე დავაყენებ, ამ პროგრამას მიაქვს ოღონდ ოხრად რესურსები (შესაძლოა გამოთვლებისთვის დღეებიც დასჭირდეს) არსებობს სხვა მოლეკულური დინამიკის სიმულატორებიც, მათი სწავლა მომიწევს სადოქტორო დისერტაციისთვის, ეს პროგი შემხვდა რამდენიმე სტატიაში და ამიტომ წინასწარ "თვალის შევლება"მომინდა P.S: გამოთვლების დაჩქარებისთვის კარგი იქნებოდა ამ პროგის 64 ბიტიანში გადაწერა (მარტო კომპილაცია არ შველის როგორც ვიცი) და ძლიერ კომპზე გაშვება (4ბირთვიანი პროცით და ოხრად გიგაბაიტი RAM-ით, მაგრამ სიდან :chojinfc:
ზუბა Posted February 11, 2011 Posted February 11, 2011 მოლეკულური სიმულატორებიდან QMol-საც შეგიძლია გადახედო : http://en.bio-soft.net/3d/qmol.html ადრე ჩემი ძმა მუშაობდა ანალოგიურ პროექტზე და მეც მქონდა კოდთან შეხება, PDB ფაილებს ხსნის როგორც მახსოვს, ეგენი მოლეკულის ფაილებია და კიდე გუგლის scetchup-ის სტუდიაში გაკეთებული მოლეკულების ვიზუალიზაციის მხარდაჭერაც ქონდა მაგ სორსს რაც შეეხება, კონსოლური აპლიკაციაა ანუ გრაფიკული ინტერფეისი არ გააჩნია და მაგის გავინდოზავრება არ იქნება ძნელი უბრალოდ კონსოლის ფანჯარაში გაეშვება, კოდს გადავხედე და ყველაფერს სტანდარტულს იყენებს გარდა თარიღის და დროის ფუნქციებისა, ეგენი unix-ის ბიბლიოთეკებიდან აქვს გამოძახებული P.S: გამოთვლების დაჩქარებისთვის კარგი იქნებოდა ამ პროგის 64 ბიტიანში გადაწერა (მარტო კომპილაცია არ შველის როგორც ვიცი) და ძლიერ კომპზე გაშვება (4ბირთვიანი პროცით და ოხრად გიგაბაიტი RAM-ით, მაგრამ სიდან :chojinfc: 100%-იანი ხარ, მარტო 64 ბიტიანზე დაკომპილირება არ ივარგებს, ის ბონუს რეგისტრები უნდა გამოიყენოს პროგრამამ რაც 64 ბიტიან რეჟიმში აქვს სისტემას, და მაგარ სისტემაზე რო გაეშვას მრავალნაკადიანი უნდა გახდეს ანუ thread-ებში უნდა გაეშვას ყველა ბრძანება :)
gio_kiborg Posted February 11, 2011 Author Posted February 11, 2011 მოლეკულური სიმულატორებიდან QMol-საც შეგიძლია გადახედო : http://en.bio-soft.net/3d/qmol.html ადრე ჩემი ძმა მუშაობდა ანალოგიურ პროექტზე და მეც მქონდა კოდთან შეხება, PDB ფაილებს ხსნის როგორც მახსოვს, ეგენი მოლეკულის ფაილებია და კიდე გუგლის scetchup-ის სტუდიაში გაკეთებული მოლეკულების ვიზუალიზაციის მხარდაჭერაც ქონდა მაგ სორსს რაც შეეხება, კონსოლური აპლიკაციაა ანუ გრაფიკული ინტერფეისი არ გააჩნია და მაგის გავინდოზავრება არ იქნება ძნელი უბრალოდ კონსოლის ფანჯარაში გაეშვება, კოდს გადავხედე და ყველაფერს სტანდარტულს იყენებს გარდა თარიღის და დროის ფუნქციებისა, ეგენი unix-ის ბიბლიოთეკებიდან აქვს გამოძახებული ეგ პროგრამა თვითონ მოლეკულების მოდელირაბისაა როგორც მივხვდი, მე კი მოლეკულების მოძრაობის მოდელირება მჭირდება ანუ როგორ ორიენტირდება ერთმანეთთან რამდენიმე მოლეკულა ექსპერიმენტული შედეგების დასაზუსტებლად და კლასიფიკაციისთვის, თუმცა მოლეკულის მოდელებიც ხომ მინდა მაგისთვის წიგნიც მაქვს თუ როგორ დავწეროთ მოლეკულური დინამიკის სიმულატორები, მაგრამ მაგისთვის პროგრამირების ენებს რა მასწავლის მსგავსი პროგრამების უმეტესობა Command Line-ებია, GUI-ს დაწერაზე არავინ იწუხებს თავს... Mapple-შიც შეიძლება რაღაც მოდელირება (გამოთვლები) თუმცა რამდენად გამომადგება არ ვიცი, არადა Mapple-ს ჩემი ძმა იყენებს აქტიურად და მომეხმარებოდა... Qmol-ს ტრაექტორიების სიმულაციაც შეძლებია...
ზუბა Posted February 11, 2011 Posted February 11, 2011 ამ შაბათ-კვირას მეცლება და $#^#(|დები დავაკომპილირო windows-ისთვის ეგ სორსი, იქნება გამოგადგეს რამეში ;)
gio_kiborg Posted February 11, 2011 Author Posted February 11, 2011 ამ შაბათ-კვირას მეცლება და $#^#(|დები დავაკომპილირო windows-ისთვის ეგ სორსი, იქნება გამოგადგეს რამეში ვაა, ძალიან მადლობელი დაგრჩები!!! გაიხარე
ზუბა Posted February 12, 2011 Posted February 12, 2011 მოკლედ ჯერ ერთი პროექტი დავაკომპილირე მხოლოდ(pr_02_1.exe), utils-ები ცალკე dll-ში გავიტანე(pr_utils.dll); მუშაობისთვის pr_02_1.exe.in ფაილი ჭირდება, რომელშიც სახელების სიაა და რომელიც ამ გამშვების გვერდით უნდა იყოს(ანუ რა დირექტორიაშიც არის) უი, NameList-ები data-ში ყოფილა, დავატესტირებ მაგით
gio_kiborg Posted February 12, 2011 Author Posted February 12, 2011 მოკლედ ჯერ ერთი პროექტი დავაკომპილირე მხოლოდ(pr_02_1.exe), utils-ები ცალკე dll-ში გავიტანე(pr_utils.dll); მუშაობისთვის pr_02_1.exe.in ფაილი ჭირდება, რომელშიც სახელების სიაა და რომელიც ამ გამშვების გვერდით უნდა იყოს(ანუ რა დირექტორიაშიც არის) უი, NameList-ები data-ში ყოფილა, დავატესტირებ მაგით გაიხარე სპასიბა შესაძლოა ანუ ვინდოზავრზე ამუშავება?
ზუბა Posted February 12, 2011 Posted February 12, 2011 აჰა ყველაზე ნავაროტკა მეთვრამეტე პროექტი ვინდოზავრისთვის თავისი in ფაილით დაატესტირე და ნახე როგორ მუშაობს, მერე მითხარი რომელი პროექტები გინდა დავაკომპილირო, ერთ solution-ში ჩავყრი და Visual Studio-ის პროექტსაც მოგცემ http://allshares.ge/...p?id=5602E5F850
gio_kiborg Posted February 12, 2011 Author Posted February 12, 2011 აჰა ყველაზე ნავაროტკა მეთვრამეტე პროექტი ვინდოზავრისთვის თავისი in ფაილით დაატესტირე და ნახე როგორ მუშაობს, მერე მითხარი რომელი პროექტები გინდა დავაკომპილირო, ერთ solution-ში ჩავყრი და Visual Studio-ის პროექტსაც მოგცემ http://allshares.ge/...p?id=5602E5F850 ვერ გავუშვი ვერანაირად ისე, ნუღა იწვალებ, შესანიშნავი პროგი ვნახე ვინდისთვის გრაფიკული ინტერფეისით და ვიზუალიზაციის მხარდაჭერით, ასევე GPU-ს გამოყენებაც შეუძლია და სხვადასხვა კვანტური გამოთლითი პროგრამების შეთავსებაც
gio_kiborg Posted February 12, 2011 Author Posted February 12, 2011 VC Redist 2005 SP1 უნდა დავაყენე ეგეც (მეყენა და რეინსტალი გავუკეთე, მაინც არაო...)
ზუბა Posted February 12, 2011 Posted February 12, 2011 დავაყენე ეგეც (მეყენა და რეინსტალი გავუკეთე, მაინც არაო...) ეხლა ვნახე და debug-ზე დაკომპილირებული ამიტვირთავს აი release, წესით უნდა იმუშავოს http://allshares.ge/download.php?id=38A3CD7F10
gio_kiborg Posted February 12, 2011 Author Posted February 12, 2011 (edited) ეხლა ვნახე და debug-ზე დაკომპილირებული ამიტვირთავს აი release, წესით უნდა იმუშავოს http://allshares.ge/download.php?id=38A3CD7F10 გაეშვა და გამოთვალა!!! მაგრამ ალბათ ის მონაცემები რაც კომპილაციისას მიუთითე და ჩემი მონაცემები როგო უნდა ჩავუწერო? (ტექსტურ ფაილში იწერება როგორც წესი) თუ ყოველ მონაცემს ცალკე კომპილაცია უნდა? თუ pr_18_1.exe.in-ში უნდა შევცვალო? Edited February 12, 2011 by gio_kiborg
ზუბა Posted February 12, 2011 Posted February 12, 2011 გაეშვა და გამოთვალა!!! მაგრამ ალბათ ის მონაცემები რაც კომპილაციისას მიუთითე და ჩემი მონაცემები როგო უნდა ჩავუწერო? (ტექსტურ ფაილში იწერება როგორც წესი) თუ ყოველ მონაცემს ცალკე კომპილაცია უნდა? მანდ რო in ფაილია, მანდ ჩაასწორე და ეგაა, მე არაფერი მიმითითებია პროგრამულად, ფაილიდან კითხულობს ყველაფერს ;)
gio_kiborg Posted February 12, 2011 Author Posted February 12, 2011 ხო, ეგაა ვნახე მეც ჩავასწორე და სხვა ციფრები მომცა გაიხარე სპასიბა!!! (სწრაფად მუშაობს ისე, გავურთულებ აბა საქმეს რას იზამს...)
ზუბა Posted February 12, 2011 Posted February 12, 2011 თუ რამე დახმარება შემეძლება მომავალშიც შეგიძლია დამიკავშირდე ;)
gio_kiborg Posted February 12, 2011 Author Posted February 12, 2011 თუ რამე დახმარება შემეძლება მომავალშიც შეგიძლია დამიკავშირდე გაიხარე, დიდი მადლობა ვხურავ ტოპიკს
Recommended Posts